2014年10月16日 星期四

NCBI application on target gene and CLC

1. NCBL:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/

先到NCBL的網站上,選Gene然後搜尋所要的基因。在這邊我所要搜尋的是MIF(Macrophage migration inhibitory factor)。

2. 點選完所要查詢的target,會出現許多的相關資訊。
 

3. 點選FASTA後進到下一個頁面,然後點選Send>>Complete Record>>File>>FASTA>>Create File,把所要的基因序列download。

4. 把download下來的基因序列,用CLC軟體開啟。


2014年10月9日 星期四

DisGeNET的應用

1. DisGeNET:http://www.disgenet.org/web/DisGeNET/v2.1/home


DisGeNeT是一個線上資料庫,可以從已知的疾病或是基因去查詢相關的資料。
在這邊我所查詢的是與我目前研究題目相關的疾病-Acute myocardial ischamia來作為應用。
首先進到網站後,在search的地方打上所要查詢的疾病或是基因,接著會出現相關的資料。

2. 從搜尋的結果中,首先看到的是和Acute myocardial ischemia最相關的7個基因(網站通常會列出前10個最相關的基因)。

3. 結果中也列出了和Acute myocardial ischemia最相關的10個疾病。

4. 分別按下右下角的Browse details可以做更進階的搜尋,且網站會把不同的基因和疾病做分類,並以表格的方式呈現出來。